患者的病史可提示诊断，并可通过下列检查予以确诊。胃癌可能与溃疡病症状相似，必须排除，特别是年老，体重减轻或诉有严重或顽固性症状的患者。内镜，细胞学检查和多次活检是鉴别良性和恶性溃疡的可靠方法。由于十二指肠溃疡恶变的发生率极低，通常不需要活检。对具有严重溃疡素质的患者，特别是多发性溃疡和位于非典型部位的溃疡(如球后溃疡)，应考虑胃泌素分泌的恶性疾病和胃泌素瘤。

　　纤维内镜检查是诊断和治疗消化性溃疡的有力手段，另一种诊断方法是气钡对照双重造影，虽然两种方法具有相同的敏感性，但内镜越来越成为诊断的选择。内镜检查对诊断食管炎，食管溃疡及位于胃后壁或吻合口的溃疡更为可靠。相反，约10%的球部溃疡和球后溃疡可为内镜检查所漏诊，当临床症状高度怀疑时，有时可通过钡剂检查进行随访。内镜检查可对胃和食管病变作活检和细胞刷检查，以鉴别简单的溃疡或溃疡性胃癌。内镜检查也可用于确诊幽门螺杆菌感染。